Xưa kia xã Bảo Yên gồm có 3 làng: Thượng Lộc, Bảo Yên và Viễn Lãm. Hiện nay, toàn xã được chia làm 25 khu hành chính,
Làng Thượng Lộc, Bảo Yên xưa kia còn có tên gọi là xóm Kỳ Lãm, xã Bảo Khang. Ngược dòng lịch sử, tìm hiểu địa danh làng, xã qua các thời kỳ ta thấy vùng đất này có sự thay đổi về tên gọi và địa giới hành chính như sau:
Thời Hùng Vương, Bảo Khang thuộc Bộ Văn Lang.
Năm 111TCN, Bảo Khang thuộc huyện Mê Linh. thuộc Thế kỷ III - V, Bảo Khang thuộc quận Tân Xương.
Thế kỷ VI, Bảo Khang thuộc huyện Gia Ninh. hàng đi Thần không và Năm 621, Bảo Khang thuộc huyện Thừa Hóa, quận Phong Châu. Thời thập nhị sứ quân (944 - 967), Bảo Khang thuộc vùng kiểm soát của tướng quân Kiều Công Hãn. tỉnh Phú Thọ.
Thời Lý, Bảo Khang thuộc Châu Đà Giang.
Thời Trần, Bảo Khang thuộc Châu Đà Giang - Lộ Tam Giang.
Thời Lê, Bảo Khang thuộc huyện Thanh Nguyên phủ Gia Hưng, trấn Sơn Tây.
Thời nhà Mạc, vì phạm húy nên đổi huyện Thanh Nguyên thành huyện Thanh Xuyên, Bảo Khang thuộc huyện Thanh Xuyên, trấn Sơn Tây. Năm 1833, chia huyện Thanh Xuyên làm 2 huyện Thanh Sơn và Thanh Thủy, Bảo Khang thuộc huyện Thanh Thủy - trấn Hưng Hóa. Diệu, thi Năm 1891, Bảo Khang thuộc huyện Thanh Thủy tỉnh Hưng Hóa. Năm 1903, tỉnh lỵ Hưng Hóa chuyển lên Phú Thọ, Bảo Khang đổi thành làng Bảo Yên thuộc tổng La Phù huyện Thanh Thủy, tỉnh Phú Thọ.
Sau cách mạng tháng Tám năm 1945, Nhà nước ta xóa bỏ cấp tổng thay bằng cấp xã: làng Bảo Yên và Viễn Lãm, Thượng Lộc hợp nhất thành một xã lấy tên là xã Phú Cường, thì Bảo Yên thuộc xã Phú Cường, huyện Thanh Thủy, tỉnh Phú Thọ.
Tháng 3 năm 1968 hợp nhất 2 tỉnh Phú Thọ và Vĩnh Phúc thành tỉnh Vĩnh Phú, Bảo Yên thuộc xã Phú Cường, huyện Thanh Thủy, tỉnh Vĩnh Phú.
Tháng 7 năm 1977 hai huyện Tam Nông và Thanh Thủy sát nhập thành huyện Tam Thanh, xã Phú Cường đổi thành xã Bảo Yên, thì xã Bảo Yên thuộc huyện Tam Thanh, tỉnh Vĩnh Phú.
Tháng 1 năm 1997 tỉnh Phú Thọ được tái lập, thì xã Bảo Yên thuộc huyện Tam Thanh, tỉnh Phú Thọ.
Tháng 9 năm 1999 huyện Tam Thanh được tách làm 2: Tam Nông và Thanh Thủy, xã Bảo Yên thuộc huyện Thanh Thủy, tỉnh Phú Thọ.
Từ đó đến nay đền Thượng Lộc, chùa Hưng Phúc thuộc làng Thượng Lộc, xã Bảo Yên, huyện Thanh Thủy, tỉnh Phú Thọ nay là xã Thanh Thủy, tỉnh Phú Thọ.
* Đường đến di tích:
Đền Thượng Lộc, chùa Hưng Phúc (Bảo Yên) cách thủ đô Hà Nội 75km; cách trung tâm thành phố Việt Trì 50km. Du khách đến tham quan di tích đi bằng đường bộ là thuận lợi nhất:
- Du khách từ Hà Nội qua Sơn Tây, qua cầu Trung Hà, theo đường 316 tới trung tâm xã Thanh Thủy, đi tiếp khoảng 4km là tới Đền Thượng Lộc, chùa Hưng Phúc cách UBND xã 0,7km.
- Du khách từ Việt Trì qua Lâm Thao đến cầu Phong Châu, tới Hưng Hóa, đi theo Quốc lộ 32A đến cầu Trung Hà, theo đường 316 tới xã Thanh Thủy, đi tiếp khoảng 4 km là tới cụm di tích
Nguồn: BQL di tích